历年来，我院与众多国际机构慈善NGO组织，如国际特殊奥林匹克组织、国际防盲协会、国际眼睛保健教育中心等国际组织建立或保持着紧密的协作关系。我院还积极参与世界卫生组织（WHO）、国际防盲协会（IAPB）组织的“视觉 2020” 全球防盲统一行动。
国际特殊奥林匹克运动会组织 
从2001年开始，我们派遣教授、医师到美国、英国、爱尔兰等地参加特殊奥林匹克的全球健康运动员计划，并从此建立了与国际特奥会的密切协作关系。
l 2003年，国际特奥会在温州医学院建立全球首家国际特殊奥林匹克合作中心。
l 2004年， 瞿佳院长 和陈浩 博士应邀作为亚太崎岖代表参加全球首本特奥眼科教材的编写和审阅。同年秋，以特奥创始人尤妮斯.肯尼迪. 施赖弗 女士命名的全球首家特殊奥林匹克运动医学健康中心在温州医学院建立，为更多的智障和弱势群体提供健康支持。
l 2005年，肯尼迪基金会在温州医学院特奥运动医学健康中心建立专项基金，旨在帮助需要科手术治疗的智障等弱势群体儿童。
l 2006年，由国际特奥会、中国特奥会和温州医学院共同主办了2006年特奥“健康运动员计划”培训会议暨特奥健康日。
l 2007年特奥新疆光明行。让新疆的贫困智障儿童在春节之前重获光明，我院启用了肯尼迪-特奥眼科手术基金，为他们带去一个五彩缤纷的光明世界。
l 2008年5月9日，国际特奥会在北京举办答谢招待会，我院瞿佳院长因领导创建全球首家特奥合作中心和特奥运动健康中心而获得嘉奖，同时作为志愿者代表获得表彰的还有我院 吕帆 教授和陈浩医生。
l 2010年11月，中国残疾人联合会、国家体育总局联合表彰2006—2010年全国特奥工作先进单位、先进个人和优秀特奥运动员。温州医学院获先进单位称号，我院陈浩副院长获先进个人荣誉称号。
